Организации и предприниматели на УСН не являются плательщиками НДС (п. 2 ст. 346.11 НК РФ). Поэтому при реализации товаров (работ, услуг) они не выставляют покупателям счета-фактуры. Если же плательщик УСН выставит счет-фактуру с выделенным НДС, то ему придется перечислить в бюджет соответствующую сумму налога (п. 5 ст. 173 НК РФ)
Таким образом, продавцы на УСН платят НДС в бюджет только в случае выставления покупателю счета-фактуры с выделенной суммой этого налога. Если такой счет-фактура не выставлялся, то «упрощенщик» не обязан перечислять НДС в бюджет. Даже в том случае, если покупатель выделил сумму НДС в платежном поручении
Источник: Письмо Минфина РФ от 19.03.24 № 03-07-11/24203